376 papers
Dit hoofdstuk bespreekt de huidige computationele strategieën, beperkingen en toekomstige kansen voor het in silico verkennen van RNA-conformatie-ensembles, met een focus op energie-landschappen en atomaire simulaties.
Dit onderzoek toont aan dat kleine extracellulaire vesikels uit de embryonale cortex neuroprotectieve effecten bieden via een CaMKIIα-gemedieerde signaleringsroute, waardoor ze de stabiliteit van microtubuli en mitochondriale functie in verouderde neuronen kunnen herstellen.
Deze studie onthult dat de transcriptiefactor FOXC1 de expressie van ARHGAP36 reguleert, wat leidt tot verhoogde Hedgehog-signalering en in neuroblastoom-patiënten correleert met een betere vijfjaarsoverleving.
Dit onderzoek onthult dat spirocheten hun verminderde vermogen om promotoren te smelten compenseren via CarD en een unieke transcriptiestrategie hanteren waarbij het -35-element vroeg wordt losgelaten, wat bijdraagt aan het begrip van de genregulatie in deze pathogene bacteriën.
Deze studie onthult dat genotoxische stress de skipping van acht exonen in het proto-oncogeen MDM2 reguleert via een distaal element in het laatste exon, wat het 'Exon Regulon'-model ondersteunt en nieuwe perspectieven biedt voor het ontwikkelen van kankertherapieën die gericht zijn op specifieke splicevarianten.
Deze studie introduceert een nieuw, omkeerbaar en tijd-gecontroleerd neuronale model met geïnduceerde SIRT6-deficiëntie dat de transcriptomische overgang van normale veroudering naar neurodegeneratie nabootst en nieuwe inzichten biedt in de mechanismen van Alzheimer.
Dit onderzoek toont aan dat de histonvariant H2A.Z-mutant R80C, door nucleosoomstabiliteit te verstoren en H3K27ac bij SASP-loci te verminderen, het senescentie-geassocieerde secretorische fenotype (SASP) onderdrukt zonder de celcyclusgenen te beïnvloeden.
Deze studie introduceert een CHACR-rapportagesysteem om het mechanisme van Cas9-gemedieerde alleelconversie te ontrafelen en aan te tonen dat de efficiëntie van dit proces, dat mutaties kan herstellen door gebruik te maken van het homologe allel als template, kan worden verhoogd door DNA-PKcs-remming of RAD51-overexpressie.
Dit onderzoek toont aan dat de gist *Komagataella phaffii* als uitzondering onder schimmels twee functionele Pho4-transcriptiefactoren bezit die gezamenlijk en deels overlappend een cruciale rol spelen bij de aanpassing aan fosfaattekort en alkalische stress.
Transcriptomische analyses tonen aan dat haaien, in vergelijking met roggen en schorpioenvissen, een significant hogere expressie vertonen van vier belangrijke DNA-reparatiepaden, wat mogelijk bijdraagt aan hun betere weerstand tegen genotoxische schade in vervuilde oceanen.
Dit artikel is ingetrokken omdat de auteurs het manuscript wegens het opnemen van aanvullende gegevens en een ingrijpende revisie niet meer als referentie willen laten citeren.
In deze studie wordt aangetoond dat een allel-specifiek antisense-oligonucleotide, dat specifiek de mutante EFEMP1-transcripten in een door patiënten afgeleid model van Doyne-honeycomb-netvliesdystrofie elimineert, effectief de extracellulaire afzettingen en intracellulaire lipidenophoping kan verminderen, zelfs na het ontstaan van de ziekteverschijnselen.
Deze studie onthult dat aneuploïdie in kankercellen leidt tot ROS-resistentie en verhoogde metastase door lysosomale disfunctie die CEBPB activeert, wat op zijn beurt PARP1 onderdrukt en zo PARP1-gemedieerde celdood na oxidatieve stress verhindert.
Deze studie toont aan dat leeftijdsgebonden veranderingen in de samenstelling van celmembranen de structuur van α-synucleine-fibrillen beïnvloeden, waardoor deze fibrillen sterkere neuronale pathologieën veroorzaken dan lipide-vrije fibrillen.
Deze paper introduceert twee trainingsvrije conditioneringsstrategieën voor flow-matching-modellen die het mogelijk maken om bio-isostere 3D-moleculen te genereren met behoud van essentiële eigenschappen zoals vorm en farmacoforen, zonder dat kostbare hertraining nodig is.